Aussi bien qu’après une planification de la capacité ou comme étape de la planification même, le département planification doit programmer la production en fonction d’une ressource, humaines ou de la machine. Le module MQM offre un tableau Gantt graphique avec des règles définies par l’usager pour rendre le processus de programmation plus précis et efficient, en fournissant des meilleurs résultats plus rapidement.

MQM considèrent la date de débout et de fin planifiées de chaque étape et représente fenêtre de planification au programmateur, avec des codes de couleur pour chaque machine qui indiquent la meilleure solution  et aussi les travaux programmés avant en utilisant différents codes de couleur pour indiquer les opportunité qui réduit les temps de préparation. Le système calcule dynamiquement les temps de préparation sur la base de la séquence des étapes de production et les caractéristiques des produits.

En plus des ressources de production, capacité et dates, le système MQM considère autres obstacles. Le système peut être configuré afin de contrôler les dates de disponibilité du matériel au moment de la programmation, contrôler les successives ou futures areas de productions, afin d’assurer que chaque superposition soit dans les tolérances configurées, contrôler les restriction de capacité comme par exemple les niveaux d’outils ou de personnel pour assurer que le programme soit exécutable, et considère aussi les dates de programmation d’autres produits sur le même ordre pour assurer leur complétement dans un délais de temps acceptable.

MQM a aussi une capacité de séquencement automatique. Le programme définie les règles, en utilisant des heuristiques afin de balancer une de livraison ponctuelle, implications des frais d’installation et réduction du WIP. Le système va programmer automatiquement toute la production que les règles lui permettent et peut fonctionner dans des interactions multiples avec un relâchement des restrictions, si nécessaire. Finalement, les dernières étapes de production peuvent être insérées manuellement sur un diagramme Gantt par le programmateur.

Quand le MQM est intégré au PRE ou aux systèmes de recueille de donnés du magasin (manuelle ou automatique), le programme sera mis-au-jour afin de refléter la réalité des flux de production enregistrés. Cela va alerter le programmateur des travaux en retard et de l’impact sur les successifs travaux planifiés, ou bien l’opportunité de déplacer la production en avant à cause des processus plus efficients.