Quer depois de ter ocorrido o planeamento da capacidade ou como uma etapa do próprio planeamento de capacidade, o departamento de planeamento deverá programar a produção de recursos, humanos e/ou máquinas. O módulo MQM fornece um diagrama de Gantt gráfico com regras definidas pelo utilizador para tornar o processo de programação mais preciso e mais eficiente, proporcionando melhores resultados em menos tempo.

MQM considera a data prevista de início e fim de cada etapa e apresenta no painel de planeamento, com máquinas codificadas por cores, o melhor ajuste de ordens de produção e trabalhos previamente programados codificados por cores também, indicando as melhores oportunidades de reduzir o tempo de preparação. O sistema calcula dinamicamente o tempo de preparação com base na sequência de fases do produto e das características dos produtos.

Além dos recursos de produção, capacidades e datas, o sistema MQM considera outras restrições. O sistema pode ser configurado para verificar datas de disponibilidade de material a programar, verificar áreas de produção futuras ou subsequentes para assegurar que qualquer sobreposição esteja dentro das tolerâncias previstas; verificar restrições de não-capacidade, tais como ferramentas ou níveis de pessoal, para assegurar que a programação seja executável, e considerar as datas de programação de outros produtos na mesma encomenda, para assegurar que sejam acabados num período de tempo aceitável, entre outras considerações.

O MQM tem uma capacidade de sequenciação automática. A programação define as regras, utilizando a heurística para equilibrar a entrega no prazo, as implicações de custos de configuração e a redução do WIP. O sistema programará automaticamente toda a produção que as regras permitem e pode ser executada em múltiplas iterações com restrições de flexibilização, se necessário. Em última análise, as poucas etapas de produção restantes não programadas automaticamente podem ser colocadas manualmente no diagrama de Gantt pelo programador.

Quando o MQM está integrado com o ERP NOW ou com os sistemas de recolha de dados do chão de fábrica (manual ou automático), a programação será atualizada para refletir a realidade da produção. Isto alerta o planeador para os trabalhos em atrasado e o impacto nos trabalhos subsequentes na programação, ou a oportunidade de fazer avançar a produção para um processamento mais eficiente.